对于亚临床甲减的治疗一般是应用甲状腺药物进行补充治疗。一般选用药物，从小剂量开始服用，注意定期复查甲状腺功能。另外，一部分食物中也含有碘，可以达到补充甲状腺素的效果，比如海带。临床甲减病人忌用生甲状腺肿的食物，比如避免食用卷心菜、白菜、油菜、木薯、核桃等，以免发生甲状腺肿大。
亚临床甲减是没有明显的临床症状，例如典型的甲低表现，眼睛肿、皮肤干燥、大便干燥、记忆力差，但是可能会有生化检查的异常。例如血脂高、TSH高，而没有特别明显的临床上的表现，即亚临床甲减。所有临床上只要前面加一个亚字，就是临床症状不典型。
亚临床甲减引起先天因素：甲状腺发育异常、甲状腺激素合成障碍等；后天因素：桥本甲状腺炎、抗甲状腺药物的治疗、亚急性甲状腺炎等；医源性甲状腺炎：甲亢经抗甲状腺药物治疗、甲状腺切除术后、甲状腺放射碘治疗后等，医源性因素是亚临床甲减第二类常见原因。
婴儿甲减又称呆小症。一般在新生儿时期主要表现为不爱动、不爱哭、反应差、爱睡觉、肌张力低下，此外还常常有喂奶困难、腹胀、便秘、生理性黄疸延长、体温低等。3个月后症状表现有：特殊面容：颜面臃肿、眼距宽、鼻骨扁平、舌头大而宽厚且常伸于口外、毛发干枯。
亚临床甲减患者通常无特殊表现，因此造成亚临床甲减病人诊断病情，常因查体时被查出。
亚临床甲减常发生于女性，男性相对较少。亚临床甲减者，若症状较明显，会有和甲减一样的症状，如感觉无力、困倦、反应迟缓等，会出现便秘，皮肤干燥，粗糙，毛发干枯，脱落。有些病人可有三分之一眉毛以外的部分脱落，许多病例合并高胡萝卜素血症，病人表现为手和脚呈姜黄色。此外还容易出现恶心呕吐等情况，还有一些人会出现贫血。测试病人肝功，还可发生肝功能异常，血脂可有高脂血症。
一般来说，亚临床甲减可以怀孕，具体分析如下：
临床甲减，如果病情得到了良好的治疗，治愈后是可以怀孕，但是如果病情没有稳定，尽量不要怀孕，可能会对孩子的智力发育会有一定的影响的。
应该注意休息，早睡早起，不要进行重体力劳动，避免剧烈运动，同时保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，保持良好的饮食习惯和睡眠习惯，少吃零食、速食，有利于身体的恢复。