根管治疗填充后，牙齿又胀又疼有可能是对充填材料的反应，也有可能是根充材料超出根尖孔，导致的牙根尖区疼痛。应该到口腔科或牙体牙髓病科复诊，拍口腔全景片或牙片，明确牙根尖和根管的情况。
牙齿做完根管治疗还疼的原因一种是牙髓没有清理干净，还残留着，这部分叫残髓炎，会出现疼痛。还有就是做完治疗以后，根尖地方没有处理好，把根尖破坏了，或者激惹了根尖组织，牙齿也会出现疼痛。
牙髓炎表现为自发性阵发性疼痛，夜间疼痛加重，疼痛不能自行定位，热疼冷缓解，牙髓腔是封闭的组织，一旦发生感染是不可逆的，必须进行根管治疗，根管治疗后的牙齿再发炎可以口服消炎止痛药。平时养成良好的口腔卫生习惯，按时刷牙，不吃甜食，定期的检查牙齿。
可能是牙髓组织水肿没有引流通畅引起的，直接堵上失活剂以后无法进行引流，出现疼痛。根管治疗封药疼痛，都出现在杀神经的时候，也就是第一次进行治疗，先开髓然后在髓腔里封闭失活剂。
根管治疗以后由于牙齿失去了牙髓，就没有营养、血供了，剩余的牙体组织就会逐渐变脆，失去牙齿特有的硬度和弹性，而且剩余的牙体组织有缺损，所以在进食的时候，如果吃硬物或者有其他的咬合干扰的话，牙体组织不能够承受足够的咬合力，很容易发生牙体劈裂、折断。
根管治疗是牙齿的一个常见治疗方法，对于大大部分的牙齿疾病，都可以考虑使用根管治疗，比如蛀牙，牙髓炎等疾病，尽管治疗的时候，应当尽可能选择在身体良好的时候进行，还应当避免在牙齿出现炎症现象的时候进行，治疗之后，也应当做好牙齿的护理上班，以延长牙齿的使用时间。