乙肝小三阳肝功能异常，表明体内乙肝病毒对肝细胞已构成损伤，或受周围环境的影响而诱发，可以通过药物治疗、日常护理等方式进行处理。
患者需要及时就医，并且根据自身情况进行合理用药，同时还应该做好心理上的护理工作。建议病人在发现自己的疾病后，马上去正规的医院进行检查和治疗，以免耽误病情，因而错失了治疗的最佳时机。如果没有及时得到诊断的话，可以继续服用保肝药物进行治疗，同时也可以配合使用抗病毒药物进行治疗。治疗过程中必须遵医嘱，切勿自行随意停药，以免影响疗效。同时要定期复查一下肝病指标，及时进行调整。
此外，平时要注意休息和进食，可以增强身体抵抗力。
乙肝小三阳肝功能异常的治疗尚没有特异性，主要的治疗是抗病毒治疗，恢复肝功、抗病毒、阻止肝纤维化三结合。没有一种药物可以直接杀灭乙肝病毒，而自身的免疫系统可以清除乙肝病毒。应恢复肝功能，免除肝功能持续损害，避免肝硬化的发生。
孕妇患有乙肝小三阳可以通过以下方式进行处理：
如果是乙肝小三阳，也不用担心，要到感染科进行检查，做乙肝DNA、肝功能、腹部彩超等相关的检查，以确定肝功能是否正常。如果病情比较眼红，需要进行药物的抗菌治疗，也可以通过口服替诺福韦进行药物的抗菌治疗。新生儿在12个月之内要进行规范的阻断，同时要在12个小时之内进行乙肝疫苗和乙肝有效免疫球蛋白。
这主要是乙肝病毒感染，出现病毒复制导致的，还有就是怀孕以后肝脏的负担加重引起的。可以注射免疫球蛋白进行治疗，注意休息，避免感冒，清淡饮食，加强营养，宝宝出生后接种疫苗。
如果是乙肝小三阳，很多是不需要治疗的，需要检查一下肝功能和腹部彩超或者腹部CT。如果肝功能正常，腹部彩超或腹部CT没有慢性肝病或者肝硬化的表现，可以定期复查肝功、腹部彩超，一般不需要特殊治疗，但是要注意不要过于劳累，不要喝酒。如果有肝功转氨酶升高，腹部彩超、CT提示有慢性肝病或者肝硬化的表现，可以使用保肝药物。
