小面积肺栓塞，未引起血流动力学紊乱，如低血压、休克、心力衰竭，可进行抗凝治疗，如肝素、低分子肝素，大面积肺栓塞、急性血流动力学紊乱者，进行溶栓治疗，如尿激酶、纤溶酶原激活剂。
肺栓塞的症状表现有很多，主要是由于肺部动脉血管发生堵塞而产生的症状，症状表现的轻重跟堵塞的程度有关系，主要表现为呼吸困难和晕厥，如果肺栓塞的症状比较严重，还会出现胸痛或咳血的症状，都是由于肺部栓塞而引起的，有些肺栓塞起病原因比较缓慢，不容易被发现，大部分患者都会出现呼吸困难和胸闷气短的症状，肺栓塞情况严重的，需要进行溶栓处理，避免出现低氧血症和呼吸困难而威胁到生命。
溶栓药物是指以纤维蛋白溶酶原激活剂激活血栓中纤维蛋白溶酶原，使转变为纤维蛋白溶酶而溶解血管内的血栓。临床上急性心肌梗死患者常用的溶栓药有以下三类尿激酶，一般是30分钟内给予静滴150万-200万单位，链激酶一般是以150万单位静脉滴注，60分钟内滴完。
肺栓塞早期症状表现为气短，多为劳力性气短，比如上楼时出现，休息时可缓解。也有一些可以出现轻微的咳嗽症状，咳少许的白痰。还有一部分人出现低热症状。因此肺栓塞的早期症状，实际上可以表现为多种多样，缺乏一定的特异性，与肺动脉堵塞的程度和速度有关。
肺栓塞介入治疗主要是指用微创的方法，到达堵塞的脉动脉，抽吸血栓部分取代手术治疗，被栓塞介入治疗，是目前非常好的抗凝和溶栓治疗的一种手段，对栓塞患者本身就会出现血栓脱落的情况，患者是高龄或左肾功能不全，不管是溶栓还是抗凝出血的风险还是比较大的，此时需要通过介入方法治疗，介入方法就是利用一根管子进入到肺动脉当中，将血栓进一步捣碎，局部再给予小剂量的溶栓药物，进而肺栓塞患者的症状会得到有所缓解。
肺心病晚期肺栓塞的患者，在进行肺栓塞的治疗过程中，首先要保证病人能够充分的吸入新鲜的氧气，同时要多卧床，同时要进行常规的体检，以明确具体的情况，以便进行进一步的治疗。此外，对于肺部血栓形成的患者，可以进行一些抗凝的药物，这是一种比较好的抗血栓药物，但要根据患者的面积、症状和类型来进行抗凝的药物。在肺栓塞的治疗中，还可以进行外科治疗，外科治疗有阻塞和切除两种。要想彻底治疗肺部血栓形成，需要考虑到肺动脉血栓的种类和表现。
