最常见的不良反应为便秘、胃肠胀气、消化不良和腹痛，通常在继续用药后缓解。胃肠道功能异常，常见，便秘，胃肠胀气，消化不良，恶心，腹泻。血液和淋巴系统功能异常，免疫系统功能异常。
长期服用阿托伐他汀钙片是有副作用的，不良反应一般比较轻，最常见的是便秘、腹胀、消化不良和腹痛，但长期服用最大的副作用是对肝功能的影响，可以引起转氨酶的升高，所以要定期复查。
阿托伐他汀钙片长期服用是没什么禁忌的。动脉硬化的治疗首先要做到生活方式的改变，包括戒烟、加强锻炼、控制体重、低盐低脂饮食等。预防性应用抗血小板药物可显著降低缺血性脑血管疾病的发生率，可每日口服药物可稳定斑块、显著降低心脑血管事件的发生率和病死率。
该药是降低血脂的药物，一旦血脂正常需要停药，不主张长期服用。低盐低脂饮食，适当的运动和锻炼，是控制血脂的关键。副作用是升高肝脏的转氨酶，如果转氨酶升高需要停药。
阿托伐他汀钙片最常见的不良反应是横纹肌溶解，还有肌病、肝酶异常，其他的还包括，比如鼻咽炎、关节痛、腹泻、四肢痛、泌尿道感染、消化不良、恶心、骨骼肌痛、肌肉痉挛、失眠、咽喉痛。在全身症状上表现，可能会出现身体不适、发热。
一般情况下，冠心病可以吃阿托伐他汀钙片，具体内容如下：
阿托伐他汀钙是治疗冠心病的首选药物。阿托伐他汀钙片能有效地降低低密度脂蛋白，但是需要严格控制其用量，同时还要对其进行血脂及肝脏功能的监控。但有的病人肝脏功能很差，有的服用了后会产生肌肉溶解，药物会产生很大的不良反应，因此不能服用阿托伐他汀钙剂，应改为通过肾脏进行代谢的药物，比如普伐他汀、瑞舒伐他汀等，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
