房颤手术后还会复发，即在X射线血管造影的监督下，通过血管穿刺将电极导管插入异常结构的位置，并在该位置局部释放高频电流，从而通过热疗使局部组织中的水分蒸发、干燥和坏死。
房颤消融术后复发采用肺静脉电隔离术，术后1年的复发概率大概是20%-40%，术后5年的复发概率大概是50%左右。如果患者为非阵发性心房纤颤，采用的是肺静脉电隔离术的方法，术后1年窦律的维持率仅为36%-60%；如果是术后长期窦律维持率，仅为20%-42%。所以，对于心房纤颤的患者，虽然首选射频消融治疗，但是，也并不代表射频消融后可以一劳永逸，射频消融后术后患者仍存在复发的可能。
一般情况下，患者可以通过以下方式减少房颤复发：
如果房颤在通过转律或射频消融术后都能回复到正常的窦律状态，为了减少房颤复发，患者要及时的调整自己的血压，避免出现房颤的反复发作。其次可以口服他汀类的降血脂的药，可以缓解血管的炎症，同时还可以减少房颤复发。还可以增加一些抗心律不齐的药物，比如倍他受体阻断剂美托洛尔，能够维持窦性心律，从而减少房颤复发。
房颤射频消融术是房颤射频消融术，存在栓塞、肺静脉狭窄、急性心包填塞等风险。
心房颤射频消融术是一种将电极管送入心脏的方法，通过释放电流，使心内膜和心内膜下的心肌坏死，从而达到治疗房颤的目的。虽然微创手术很常见，但仍有一定的危险性。该手术对心内膜的损伤，会导致局部血栓形成，血栓随着血液循环进入体循环，导致急性脑血栓栓塞，患者会出现偏瘫、失语、昏迷等症状。房颤射频消融术在肺静脉环上进行，术后可能发生肺静脉狭窄，若操作不当，可造成心脏穿孔、急性心包填塞，有较高的猝死几率。
但随着医疗技术的进步和经验的积累，射频消融手术的成功率和安全性得到提高，目前手术的危险性明显降低。正规医院的成功率在90%以上。
复发率是10%-20%左右，当房颤发作频繁并且症状明显时，可以考虑进行房颤消融术或者房颤伴有预激综合征，也可以考虑行消融术，房颤伴有快速心室率而药物治疗无效的人，也可以施行房室结消融或者改良术。