小儿感染性心内膜炎的治疗方法有一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
1.一般治疗：一般治疗需要注意细心护理，保证小儿充足的热量供应，可少量多次输新鲜血或血浆，也可输注丙种球蛋白。
2.药物治疗：小儿感染性心内膜炎可以在医生的指导下使用药物进行治疗，比如万古霉素、青霉素、庆大霉素等，具体方法应根据具体情况决定。
3.手术治疗：如果药物治疗无效，病情仍旧比较严重，小儿感染性心内膜炎需要通过手术进行治疗。
感染性心内膜炎指因细菌、真菌和其它微生物直接感染而产生心瓣膜或心室壁内膜的炎症，有别于由于风湿热、类风湿、系统性红斑性狼疮等所致的非感染性心内膜炎。感染性心内膜炎典型的表现有发热、杂音、贫血、栓塞、皮肤病损、脾肿大和血培养阳性等。
感染性心内膜炎治疗方法有内科治疗，对于感染性心内膜炎要通过血培养选择使用针对治病细菌敏感、强力杀菌抗生素。外科治疗，对于心内膜有赘生物形成或心脏瓣膜结构已发生变化的，给予心脏外科手术的治疗。
临床上有两种情况，一种是因为微小的或巨大的栓子造成的。这是一种常见的肾动脉栓塞，也就是肾梗死。
如果出现了栓塞性肾炎和肾脏梗塞，那就很危险了。另外，也会导致免疫功能紊乱，局部病变，肾小球肾炎，肾脏坏死或者是扩散，就像是一个链球菌，又像是被细菌感染后的肾炎，如果发现了这种症状，应该去正规的医院进行相关的体检，以确定病变的部位。
一般情况下，感染性心内膜炎分为急性感染性心内膜炎和亚急性感染性心内膜炎，不同的情况，但是主要是用药物进行治疗。具体内容如下：
急性感染性心内膜炎相对较少，起病较急，致病菌毒力较强。关于感染性心内膜炎的治疗方法，首先是抗病原微生物治疗，其次是对症治疗和外科手术治疗。如果出现并发症，比如心衰，心律失常，需要对症治疗，必要时需要外科手术进行瓣膜置换术。
建议患者注意生活习惯改变：戒烟限酒，低脂低盐饮食，适当体育锻炼，控制体重等。
感染性心内膜炎疗程亦要足够长，力求治愈，一般为4～6周。对临床高度怀疑本病，而血培养反复阴性者，可凭经验按肠球菌及金黄色葡萄球菌感染，选用大剂量药物治疗2周，同时作血培养和血清学检查，除外真菌，支原体，立克次体引起的感染。若无效，改用其他杀菌剂药物，感染心内膜炎复发时，应再治疗，且疗程宜适当延长。