可以表现为腹部包块，出现腹部胀痛感，如果囊肿合并了感染或者出血，可以出现腰痛、腹痛等症状。有的肾囊肿位于下极或者邻近集合系统，可以压迫输尿管，引起肾积水。可以表现为腰部胀痛感，如果同时合并的感染可以出现发热、疼痛等全身的症状。平时饮食上应当注意进行控制，应当注意低盐低脂饮食，尽量避免进食一些辛辣以及油腻等食物，不要进食动物内脏以及一些加工产品。应当尽量多吃一些新鲜蔬菜和水果，保持心情舒畅。
有可能会出现腰、腹不适或疼痛，肾脏因多囊含水量大，变得沉重，下坠牵拉，也会引起腰部疼痛。症状有疼痛，为隐痛，钝痛，固定于一侧或两侧，向下部及腰背部放射，血尿，可表现为镜下血尿或肉眼血尿。腹部肿块，有时为病人就诊的主要原因，60%—80%可触及肿大的肾脏。肾脏愈大，肾功能愈差。
左肾囊肿的症状取决于囊肿的大小。临床表现不明显，但体检时会发现肾囊肿。对于大囊肿，当出现压迫症状时，可能会出现尿路梗阻或腰痛和尿路感染。具体的治疗方法需要根据囊肿的大小来确定。
儿童肾囊肿早期通常没有症状。
儿童患肾囊肿要引起重视，及时治疗，囊肿逐渐增大会有腹部肿块、腰痛、血尿、蛋白尿等症状。家长要重视，要带儿童及时到医院检查治疗。一般要检查血常规、尿常规、B超及肾功能，一般通过手术的方式治疗。生活中不要吃巧克力和辛辣的食物，多休息，保证规律的作息，注意做好保暖，避免感冒。
肾囊肿破裂与肾结石急性发作往往容易混淆，都有肾虚脚痛或者是胀痛，然后有血尿或者是尿路感染的症状，因此在治疗上需要结合的临床表现选择药物治，药物治疗需要在医生的指导下进行。