可应用抗生素药物治疗。除了要正确用药外，病人平时应多喝水，饮食上注意不要吃辣的，性生活不要太频繁，注意休息，避免劳累和熬夜。注意饮食上的规律，保证充足的睡眠质量。
龟头流脓一般多见于龟头炎等导致，可以到医院外科就诊检查，根据病情采取清创消毒治疗，然后选择消炎药治疗。另外可以做一下尿常规等检查，如果是细菌感染，可以使用药物类等消炎药治疗，注意多喝水，不要吃辛辣食物，暂停性生活，不要喝酒。
小便刺痛、龟头流脓考虑是尿道炎合并龟头炎引起的不适，可能是念珠菌感染引起的。考虑与尿路感染或淋病有关系的，可以进一步检查尿常规和做尿道分泌物检查，到当地医院做个尿常规检查，如果有不干净的性生活考虑淋病可能。应该及时治疗。
尿有刺痛感、流脓需检查尿道口脓液，以确定引起尿道炎致病菌，以便选药处理。
若因大肠杆菌、淋球菌及其他感染所致，病人可口服头孢克肟分散片、头孢拉定胶囊等头孢类抗生素治疗。若由于支原体、衣原体感染所致，病人可口服如阿奇霉素、米诺环素大环内酯类抗生素治疗。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用，以免损害身体。
小便刺痛龟头流脓，首先需要考虑是尿道炎的可能性。尿道炎一般分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎两种情况。淋菌性尿道炎的致病菌指的是淋球菌，而非淋菌性尿道炎的致病菌一般是支原体或者是衣原体。
有龟头流脓，小便刺痛这种症状，可以去当地的正规医院的生殖器科就诊，或者选择国家三甲等医院就诊都是可以的，不要自己盲目的使用药品，避免病情加重。治疗期间不要有性生活，保持局部卫生，饮食清淡。