肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能已达平衡和稳定状态可观察，但应定期检查了解积水进展情况。可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。肾积水进行性加重，临床症状明显，肾功能不断下降，梗阻病因明确，有并发症存在，应手术治疗。
病因治疗，去除肾积水病因，保留肾患，手术方法取决于病因的性质，例如先天性肾盂输尿管连接部狭窄可作肾盂成形术，肾，输尿管结石可行碎石或取石术，这些手术近年可用内腔镜进行；手术治疗，对于比较严重的肾积水致患侧肾功能全部丧失或有严重感染积脓，但对侧肾功能良好，可行患肾切除术。
中药治疗无效，没有偏方，中药治疗会加重肝毒性的同时，也失去了治疗的最佳时机，目前中草药中抗肿瘤草药都有严重的肝毒性，反而在没有控制肿瘤转移的情况下，出现肝衰竭现象。
治疗肾积水的方法好的有：肾切除术，肾积水严重，剩余的肾实质过少，或伴有严重感染即肾积脓时，如对侧肾功能良好，可切除病肾；可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。
肾积水是由输尿管阻塞引起的，尿液不能正常排泄。输尿管结石或肿瘤常见原因。肾功能损害较轻的可以恢复，如果病情严重，不允许手术或梗阻不能暂时去除时，可以在b超下经皮肾穿刺。
如果肾积水合并严重感染，导致感染性休克，需及时抢救，感染性休克病死率高达50%。肾积水严重程度不同，对患者的寿命影响也不同，中重度肾积水，可能导致肾脏感染、肾脏积脓、肾功能减退，病情发展可导致肾功能不全，引发尿毒症等严重疾病，威胁患者生命单纯肾积水，对患者的寿命影响不大。
