肾多囊肿由先天的发育不良、基因突变(非遗传)、各种感染、毒素、饮食不节食物不洁、饮食偏嗜、劳力过度、劳神过度、房劳过度等原因引起的。不能吃高蛋白食品、发酵性食品、过咸类食物、动物内脏等。
肾囊肿的形成因素是多方面的，对于单纯性肾囊肿主要是由于肾脏的集合管堵塞，造成尿液分泌受阻，从而逐渐的形成囊性的扩张，引起肾脏囊肿。多囊肾于先天性遗传因素有关，属于常染色体遗传病。
肾囊肿分为单纯性肾囊肿和多囊肾。单纯性肾囊肿是因肾小管引起的变异，逐步长大引起囊肿。此类囊肿对肾功能影响较小，可待其长大后再对其进行治疗。多囊肾的形成与基因有关，往往具有遗传性，此类囊肿会对肾功能造成损伤，部分患者后期需进行血液透析治疗和腹膜透析治疗。
囊肿是一种先天性疾病，一般囊肿不会对机体产生任何危害和影响。对于囊肿而言，部分可以随着人体的增长和年龄的增高，大小可以发生改变，对脏器和组织的功能影响不大，是要有囊，也就是一个膜状的囊袋样组织结构，囊内要有液体。这两个条件都具备了就形成囊肿。
肝囊肿是最常见的肝脏良性肿瘤，是先天性、非遗传性肝内囊性病变，大体可分为寄生虫性和非寄生虫性两类。寄生虫性肝囊肿以肝虫病为多见，非寄生虫性肝囊肿又可分为先天性、创伤性、炎症性和肿瘤性囊肿。临床上90%以上见到的都是先天性肝囊肿，是由于胚胎时期肝内胆管或淋巴管发育异常造成的。
卵巢囊肿跟遗传、环境、生活方式和内分泌等因素有关。食用了使用各种生长激素的蔬菜水果，也许会导致卵巢囊肿。饮食结构不合理，长期高盐高脂饮食，生活压力过大，精神经常处于高压状态等也是卵巢囊肿的诱因。
