做肾脏穿刺可以明确肾脏是否有癌性病变，脓肿，也可以明确肾炎等。一旦发现有占位性病变，可疑是癌症，就需要做肾脏穿刺，明确具体的病理类型。肾脓肿一般在三厘米以上的时候，可以考虑做穿刺排脓，小一点的脓肿可以保守治疗。对于各种类型的肾炎病人，当蛋白尿在两个加以上的时候，可以做肾脏穿刺，这样有助于明确具体肾炎的类型，以便对症治疗。
做肾穿刺是为了诊断明确，因为肾炎的症状都非常相似，比如有血尿，蛋白尿，血肌酐异常，高血压或水肿的情况，它们从症状上都叫肾炎，但事实上肾炎的种类是非常多的。所以需要做肾穿刺，通过活检病理的形式来判断疾病是哪种类型的。不同的肾脏病治疗方案是不同的，预后也是不一样的。
如果持续出现尿潜血，可以考虑进行肾脏穿刺，肾穿刺是肾内科常见的一种有创检查方式，它可以明确病理类型，对指导治疗和判断预后有很大的意义，所以肾穿刺还是非常重要的。
肾穿刺活检术后肾脏病理检查结果已经成为肾脏疾病诊断的金指标。通过肾穿刺活检术可以使超过三分之一临床诊断得到修正，通过肾穿刺活检术可以使将近三分之一的临床治疗方案得到修改，通过肾穿刺活检术可以更为准确的评价肾脏病患者的预后。尽量做肾穿刺来治疗。
如果是特别轻微的肾炎，比如无症状性血尿、尿蛋白定量在1.0克以下，并且肾功能是正常的，此时可以不做肾穿刺，先用药物治疗。如果尿蛋白定量大于3.5克，同时伴有血尿或者肌酐升高，或者应用药物治疗效果不好，此时需要进行肾活检，明确病理类型后对症治疗。
肾穿刺的适应症是各种原因导致的肾功能轻度异常，各种原因导致的蛋白尿和不明原因的血尿，以及临床诊断明确的急性肾炎，慢性肾炎及急进性肾炎等疾病，还可在原发性或者继发性肾病综合症的情况下，考虑做肾穿刺。