肥厚性心肌病需根据具体病症进行治疗。
肥厚型心肌病一时之梗阻性肥厚型心肌疾病，针对该病的治疗，可以选择药物保守治疗，常用的药物有纠正心衰的药物、逆转心室重构的药物，例如β受体阻滞剂等。梗阻型肥厚性心肌疾病比较危险。因为梗阻往往会出现低血压、恶性心律失常、心绞痛等症状。如果心排血量受阻，会导致机体供血不足，脑供血不足，冠状动脉供血不足，这是非常危险的。一般都会选择无水酒精消融，这样可以减轻梗阻，从根本上治疗。
肥厚性心肌病治疗方法，通常以肥厚性心肌病为目标，看看属于哪类。
肥厚性心肌病主要分为两类，其一为肥厚型非梗阻性心肌病，此症病人症状常亦不显着，对病人的伤害也相对较低，通常情况下，定期复查心脏彩超即可，无须特殊处理，通常活动和工作不受明显约束，注意忌熬夜，忌暴饮暴食，改变不良习惯，但是一旦出现病症，例如，早搏的存在，在此情况下，可适当使用β受体阻断剂。
另一种就是扩张型心肌病，主要指的是心室扩大导致心功能受损的疾病，在临床上很常见，对于这种情况，应该根据其不同的临床表现和病理机制给予相应的处理方式。此外，还有肥厚型梗阻性心肌病等，肥厚型梗阻性心病的病人常有较明显的症状，除心悸外，很可能发生眩晕，甚至晕厥，此外，还可出现心衰，劳力性呼吸困难，胸闷，气喘，处理好这一状况，在用药上必须重视，忌用有心肌收缩力之药，视情况给予β受体阻断剂，恰当使用利尿剂，肥厚型梗阻性心肌病较重者可通过介入微创行酒精消融手术治疗，人为地引起局部心肌坏死以解除梗阻，从而缓解病人的病症。
肥厚性心肌病末期可以进行药物治疗，例如口服美托洛尔等。
肥厚性心肌病与恶性肿瘤有所不同，通常情况下，患者可以采用口服药物的方式进行控制，例如口服美托洛尔等。若患者同时伴有心律失常（例如室性心律失常），则可以加用胺碘酮进行治疗，若合并心功能不全，则可以加用呋塞米进行治疗，若患者出现流出道梗阻等情况，则可以考虑采用手术的方式对肥厚室间隔进行一定程度的切除。
对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
通常情况下，心尖肥厚性心肌病晚期可以通过药物、手术进行治疗。
心尖肥厚性心肌病还没有特效的药物，主要是口服倍他受体阻滞剂和血管转换酶抑制剂。药物的用量可以根据患者的血压和心跳来进行调节。倍他乐克、蒙诺等是典型的药物。到了后期，还会有心力衰竭等多种心律不齐。治疗多种并发症。可以利尿，扩张血管，增强心脏功能，缓解症状。抗心律失常的药物用于治疗各类心律失常。根据手术指征及病人的特点，选用外科手术，并将其切除。
心尖肥厚性心肌病可以通过药物进行治疗。
原发性肥厚性心肌病是一种常见的心尖肥厚性心肌病。心脏超音波能明确诊断。美托洛尔联合钙拮抗剂是治疗心脏收缩的首选药物。建议24小时进行心电图检查，以确定是否存在心律不齐。对于有心律不齐的病人，给予抗心律失常的药物如胺碘酮等。若有心衰，应给予利尿剂。没有明显的临床表现，没有明显的心律失常，可以不用药，定期做心脏超声检查即可。