脑炎的治疗方法包括对因治疗、免疫治疗以及对症处理。其中抗病毒治疗，其选药可能有一定的变化，如单纯疱疹病毒引起的脑炎，而EB病毒引起的脑炎，药物对症处理，即头痛则予以止痛，有颅高压症状则予以脱水，发烧则予以降温，包括物理降温和用药。免疫治疗即使用药物增强免疫力。
控制颅内高压、对症治疗及抗病毒治疗等方法进行治疗。另外干扰素、转移因子、免疫核糖核酸，核糖核酸酶均可酌情采用。患者生活中要积极的进行锻炼，以提高自身的抗病能力。
可以选用一些抗病毒，降颅内压的药物来进行治疗。脑膜炎的治疗原则是早期给药、合理选药、联合用药及系统治疗。脑炎一旦发作起来，常常会出现头痛、头响、精神萎靡、发烧、呕吐等症状。
对脑炎者，通常的建议是，还是选择马上入院治疗为好，并搞好隔离和防范，以免把脑炎传给别人。第二，推荐选用抗生素给药，进行腰椎穿刺并保留少许脑积液，进行了细菌培养及药物敏感试验，从试验结果看，选用高剂量针对性抗生素，作对症治疗常能收到良好的治疗效果。
此外，脑炎患者应该花椒、辣椒、芥末以及咖啡、可乐、浓茶等刺激性食物。
脑炎可能会致命，但其他年龄的人患脑干脑炎则可能会完全复原，有时候是在经过长时间患重病之后复原。虽然脑干脑炎可能造成脑的永久性损害，但产生严重后果的百分比却不高。
