在新生儿和婴幼儿时期，大部分患儿没有明显的临床表现，有的表现为轻度的黄疸，有的会表现为黄疸加重、黄疸消失推迟、睡眠减少、哭闹、纳呆、吮吸能力弱、皮肤有斑点、脸型肿胀、胸围增大、便秘、腹胀、脐疝、心跳减慢、心音低沉等。中枢性甲减伴有其它的垂体促荷尔蒙失调时，会出现低度的葡萄糖、小的、隐睾、面中线的畸形，例如：唇裂、腭裂、视神经等。
儿童期甲状腺功能减低：表情呆板，鼻扁宽，鼻梁下陷，两眼距离远，眼泡肿胀，嘴唇厚并向前突出，舌头增大，声音嘶哑，牙齿不长或稀少，个子不长或长得很慢，智力发育极差，只能照顾自己吃饭、大小便。这就属于甲状腺功能减低的症状症状。
甲状腺功能减退症，简称甲减，是由于机体甲状腺激素合成和分泌减少或甲状腺效应不足所导致的机体代谢降低的疾病。该病常累及身体多个系统，主要症状有脸色苍白、颜面部浮肿、神情淡漠、皮肤干燥、毛发脱落、体重增加、记忆力减退、智力下降、嗜睡、全身乏力等症状。
亚临床甲减患者通常无特殊表现，因此造成亚临床甲减病人诊断病情，常因查体时被查出。
亚临床甲减常发生于女性，男性相对较少。亚临床甲减者，若症状较明显，会有和甲减一样的症状，如感觉无力、困倦、反应迟缓等，会出现便秘，皮肤干燥，粗糙，毛发干枯，脱落。有些病人可有三分之一眉毛以外的部分脱落，许多病例合并高胡萝卜素血症，病人表现为手和脚呈姜黄色。此外还容易出现恶心呕吐等情况，还有一些人会出现贫血。测试病人肝功，还可发生肝功能异常，血脂可有高脂血症。
甲减症状一般不会自行消失。
患者可能会出现怕冷、反应迟钝、心动过缓、便秘、腹胀等症状，严重时会影响月经正常，甚至导致不孕不育。甲减需要用甲状腺激素替代治疗。可以先从小剂量开始，定期检测甲状腺功能，在医生的指导下逐渐增加，直到甲状腺功能恢复正常。部分患者经过一段时间的治疗，可能会逐渐减量甚至停药，达到临床治愈。大多数甲减患者最终可能需要终身应用甲状腺激素治疗。