副作用有突破性出血，阴道点状出血，体重增加或减少，乳房肿胀，恶心，头晕，头痛，倦怠感，发热，失眠，过敏伴或不伴瘙痒的皮疹，黑斑病，黄褐斑，阻塞性黄疸，肝功能异常等。发胖是比较少见的副作用，短期服用黄体酮是不会发胖的。
吃这种药物会使人发胖的，因为他是激素类药物，神经内分泌功能失调引起的。主要是下丘脑—垂体－卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病。器质病变或药物等引起，包括生殖器官局部的炎症，肿瘤及发育异常，营养不良等。
打黄体酮会失眠的。
黄体酮属于激素类药物，对睡眠有严重的影响。因为体内激素波动明显，会导致体内激素异常引起。可以选择中午或者早上服用黄体酮，这样影响比较小。如果失眠持续，也可以配合一些镇静催眠药物一起使用，这样就不会影响睡眠了。同时要掌握好黄体酮的用量，不要用太多。黄体酮属于孕激素药物在临床上可以用来调整月经周期，也可以用来进行保胎。在非孕期间用药，一般在停药后2~7天就会来月经的。
怀孕打黄体酮针对胎儿没有发现副作用，对母体的副作用是肌肉注射针剂，时间长了会减慢吸收，注射局部可能会出现疼痛、有硬结的情况，在疼痛部位上热敷可以促进吸收，减少疼痛。
该药的副作用包括以下几方面，首先长期注射黄体酮可能会引起胎儿畸形，例如造成女性胎儿男性化或者增加脊柱裂的风险，其次打黄体酮可能会造成水钠潴留，引起孕妇体重增加，组织水肿。然后打黄体酮可能会引起患者头晕以及恶心呕吐，主要是由于黄体酮有舒张颅脑血管以及刺激胃肠道的作用。
长期打这款药物是不可以的，这款药是由卵巢黄体分泌的一种天然孕激素，在体内对雌激素激发过的子宫内膜有显著形态等影响，为维持妊娠所必需.临床常用于先兆性流产，习惯性流产，子宫内膜移位症，功能性子宫出血，痛经，卵巢功能低下所致的闭经或闭经原因的反应性疹断等。
