这属于强氧化剂，通过氧化菌体的活性基团，呈现杀菌作用，高锰酸钾能有效杀灭各种细菌繁殖体、真菌、结核杆菌。在妇科方面，高锰酸钾也有重要的用途。可以用百分之0.01的量冲洗外阴，达到治疗外阴炎症的目的。
高锰酸钾能改善阴道的酸度，减少pH，并与外用外用药物治疗，有显著的疗效。
高锰酸钾是一种常见的妇科药物。在许多妇科药水还没有生产出来的时候，高锰酸钾在妇科中的应用十分普遍。主要应用于外阴的清洁、坐盆、产后的外阴清洁。女性阴道炎、细菌性阴道炎、滴虫性阴道炎都可以进行外阴清洁。
另外，高锰酸钾还具有收缩生肌的作用，可以有效地治疗会阴切口的愈合。治疗效果非常明确，而且相对实惠。主要难点在于不容易掌握它的浓度，容易引起局部烧伤。
通常一块用于混合水，颜色应该混合成浅粉色，而不是太深。如果浓度太深，用于消毒的高锰酸钾的浓度通常为1/5000，即1克高锰酸钾和4999克水。所以0.2克含999.8克水，只需用热水器里的热水就可以了，没有太大要求的。
产妇使用高锰酸钾建议在产后一周左右，通过坐盆的方式使用，连续使用建议不超过一周。
使用高锰酸钾能保持外阴干燥，有助于产后会阴部的伤口恢复，但并不需要常规使用。产后1周左右使用高锰酸钾对子宫没有影响，因为此时宫颈内口已经闭合。使用时取适量温度适宜的清水并在其中倒入适量高锰酸钾，产妇坐在高锰酸钾溶液中浸泡。但如果使用的时间过长导致外阴部皮肤过度干燥，同样不利于伤口恢复，因此浸泡时间不宜过久，每次坐盆的时间在5-8分钟左右，连续使用不宜超过1周。在使用过程中还要避免烫伤。
好多女性用高锰酸钾来清洗外阴、阴道。妇科一般建议1:5000的浓度坐浴，用来治疗白带过多、外阴瘙痒；预防泌尿系统感染；痔疮。高锰酸钾是深紫色结晶，可溶于水，因高锰酸钾有杀菌消毒作用，如果长期使用高锰酸钾洗液会将正常寄生于阴道。
