尿结石的患病原因有很多的，跟每个人的体质也是有很大的关系的，也有的是因为遗传和先天性的因素导致，如果是先天性酶缺乏就比较容易得结石病，一些内分泌失调的疾病，如甲状腺的疾病，甲状腺素分泌是否正常，跟钙的吸收和利用有很大关系。
形成尿结石原因的原因是，泌尿系统解剖异常：肾小管扩张、先天性肾盂输尿管连接处狭窄。肾盏膀胱憩室、输尿管狭窄、马蹄肾等。还有体内代谢异常如高尿酸、高胱氨酸血症、高钙血症、甲状旁腺功能亢进等。
尿结石不是特别严重，但是如果结石没有及时处理，继续长大，有可能导致肾积水，也可能最终导致肾功能衰竭，也可能出现肾积脓，最后导致单侧肾或双侧肾的肾功能不全。
尿结石是由于一些细小的石头沉积在泌尿系统而形成的。这些石头往往为钙盐结晶、磷酸盐结晶、碳酸盐混合物而成。大小在几毫米至几厘米之间，尿结石如果存在输尿管部位成为输尿管结石，输尿管结石有可能会影响小便排泄，从而出现肾积水。尿结石如果长在肾脏部位称为肾结石。平时喝水少，喜欢喝咖啡和茶叶水的人群，更加容易形成尿结石。
尿路结石的形成跟饮食习惯环境，因素职业因素等有直接的关系，如果饮食中还有较多的钙质成分，很容易引起尿液中钙盐，结晶的形成引起尿路结石，另外，如果长期在高温环境下作业由于体内水分大量蒸发也很容易引起形成。