中医讲究辨证论治。卵巢囊肿根据舌脉表现，痰盂凝结，痰饮停聚而导致气机气滞血瘀，痰饮与瘀血互结阻滞，或气虚血于导致血凝成于，发展为卵巢囊肿。可以区分为气滞、血瘀、痰湿及毒热的证型，需要根据不同证型而用药治疗。
怀孕卵巢囊肿可以是由于遗传因素造成的，还有是因为卵巢囊肿基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素，而雄激素的过量产生是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果。
卵巢是一对扁平性腺器官，卵巢囊肿是卵巢上出现囊性肿块的病变，分为生理性和病理性。其中生理性卵巢囊肿是卵巢的功能性改变，大部分体检做B超时会发现，多数情况下可自行消退；病理性卵巢囊肿常见于卵巢肿瘤主要包括上皮性肿瘤和生殖性肿瘤。卵巢囊肿发病原因众多，主要有遗传因素、环境因素或自身内分泌因素异常而引起。
卵巢囊肿一般都是由于有附件的炎症，或者是有子宫内膜异位症导致的。从中医角度来讲，是由于卵巢周围有寒湿，血瘀导致的，所以治疗起来一般都是活血化瘀，祛寒湿。定期到医院做检查，一旦发现囊肿适合手术，需及时做治疗。
卵巢囊肿有生理性的囊肿和病理性的囊肿，生理性的囊肿一般没有症状，病理性的囊肿可能引起腹痛，增大，破裂等，原因主要有：下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常，临床上很多病人和多囊卵巢综合征病人的基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素而雄激素的过量产生，是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果。
卵巢囊肿的原因有：生理性囊肿：如滤泡囊肿、黄体囊肿。病理性囊肿：如巧克力囊肿、浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等。盆腔炎症引起的输卵管卵巢囊肿。对于卵巢滤泡囊肿、黄体囊肿观察即可或口服避孕药2-3个月，多数可自行消失，不用特殊治疗。对于盆腔炎症引起的输卵管卵巢囊肿，可以对症抗炎治疗，病情进一步发展，可以考虑手术治疗。对于病理性囊肿，如卵巢巧克力囊肿、浆液性囊腺瘤等，尽快安排手术。