相对于人工流产来说，药物流产对患者的伤害并不大。
人工流产是一项有创性的手术，需要用负压吸取孕囊、血液等组织，在人工流产过程中难免会对宫腔产生伤害。而药物流产是一种可以终止怀孕的方法，是指口服药物终止早期妊娠，在药流后要到医院做B超，确定是否是子宫内怀孕后再进行药物人流。在恢复期要多休息，不要食用辣椒、大蒜等辛辣刺激的食品。
不论人流还是药流，对人体的损伤都比较大。人流与药流相比，对人体的损伤药流相对比较小，所以能做药流的尽量的选择药流，以减少对人体的损伤。人流是通过器械的宫腔操作，把宫腔内的妊娠组织吸出和刮出宫腔以外，药物流产是通过药物来作用于人体，使怀孕的妊娠组织排出体外。
怀孕初期药流和人流相比的话药流伤害会小一点。
在怀孕初期，不管药流还是人流都会对人体有一定的损害，但是两者相比药流的伤害会小一点。如果药流顺利就不需要清宫，能减少感染的几率，避免刮宫对子宫内膜造成损伤。但是也有特殊情况，药流不干净有残留，这种就要做清宫术，也会对子宫造成二次伤害。而流产虽然对子宫有一创伤，但是一般不会造成二次伤害。
从流产方式上看，药物流产对身体的伤害相对较小，但不管药物流产还是人工流产都会伤害身体。
停经49天以内的孕妇可以采用药物流产，有75%左右的成功率，若药物流产失败，则要做清宫手术，注意清宫手术对身体伤害很大。停经12周以内的孕妇可以进行人工流产，主要是通过局部麻醉，将孕囊、胚胎组织取出体外，手术成功率很高。因此，若成功进行药物流产，对身体伤害相对较小，若药物流产失败，则可能比人工流产手术伤害更大。
药流后清宫和人流，人流的伤害会更小一些。
药物流产后会出现恶心、呕吐、腹泻、腹痛等消化道反应，同时还会出现出血量过多、药物流产不彻底等症状，所以要进行二次清宫。
人流手术时有出血，穿孔，感染等，都会对子宫内膜造成一定的伤害，导致宫腔粘连，宫颈粘连等。不过现在技术已经很成熟了，而且无痛人流对身体的损伤也会更少。两者都有自己的优势和劣势，相比之下，考虑到人流对自己的影响要小得多。
人工流产是一种有创操作，需要在宫颈扩张的前提下，用负压吸引的方式将孕囊、蜕膜、血液等组织吸出体外。为了防止漏吸，一般会将宫腔清理得比较干净，一定程度上会对子宫内膜造成损伤。药物流产是使用药物而非手术的方式，终止早孕的一种避孕失败的补救措施。由于药物流产无创并且使用方便，目前临床上应用是比较广泛的。药物流产没有宫腔操作，所以流产后出血量多，出血时间长是主要副作用。