三个月宝宝不怎么吃奶首先需要积极排除疾病原因，比如呼吸道感染，胃肠功能紊乱，积极治疗疾病，如果宝宝状态好，没有疾病可能，那么就考虑是厌奶期，需要来调节饮食让宝宝吃奶，奶器具等改善。
一般来说，三个月宝宝不怎么吃奶可能是有身体方面疾病。
如果三个月宝宝不怎么吃奶，通常要检查是不是有身体方面疾病的，比如鹅口疮、溃疡等。此外，还有没有腹胀的症状。如果有鹅口疮或者溃疡，可能会因为喉咙不舒服或者疼痛导致三个月宝宝不怎么吃奶。如果有腹胀的症状，可能是消化不好，通常也不会吃奶的。如果是消化不好，家长可以遵医嘱给宝宝吃益生菌，如果是鹅口疮、溃疡等，要及时到医院去就诊。
有可能是宝宝身体的不舒服，比如受凉感冒了，或者是消化不良，都会导致食欲下降。婴幼儿由于肝脏发育尚未完善，消化酶分泌相对不足，常出现消化不良的情况。产房温度不易过高。适当通风，防止中暑。
婴儿突然不吃奶可能是多种原因导致的，具体分析如下：
首先，可能是口腔溃疡导致的，宝宝在吸吮奶头的时候会感觉到口腔的疼痛，从而导致宝宝不喝奶。也有可能是因为肠胃疾病导致的，例如肠胃炎导致的腹痛、腹泻等。大多数孩子在受到惊吓后，都会出现不喝牛奶的情况。这个时候要注意宝宝的情绪，同时，可以带宝宝去医院做一下肠胃方面的检查，看看有没有什么问题。
宝宝吃奶时干呕一般是因为婴幼儿的胃平滑肌发育尚不完善，在宝宝吃奶后容易使胃扩张，而贲门和胃底部肌张力低，幽门括约肌发育良好，所以容易发生幽门痉挛出现干呕的现象。
婴儿出生三个月厌食可能是正常的生理性的厌奶。大多数宝宝在3-4个月，7个月左右都会出现不同程度生理性的厌奶。要耐心，到时还是冲奶，试着喂，不吃就不要强迫宝宝吃，大不了大人喝掉。可以煮一点粥，将粥上面的米汤喂给宝宝喝。