一般情况下，宝宝打手足口疫苗发烧，家长可以通过物理治疗、一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是手足口疫苗引起的发烧，家长首先要监测宝宝的体温，如果宝宝的体温不超过38.5℃，说明宝宝的身体状况良好，能够正常进食、喝水，没有明显的寒颤、嗜睡等症状。这时候主要是物理降温，可以给宝宝多喝温水、贴退热贴，退热贴重点放在额头或者颈部两侧。同时可以用温水擦拭宝宝的身体，重点是在额头、颈部两侧、腋下、大腿根、腘窝、肘窝等主要动脉的位置。擦拭的时候要注意不能用白酒或者酒精兑温水擦拭宝宝，以免酒精通过皮肤吸收。另外，疫苗接种后24小时可以用温水泡澡，洗澡时要避开针眼部位。如果宝宝的体温在物理降温后逐渐恢复正常，可以继续观察。如果物理降温不起作用，体温持续升高超过38.5℃，可以服用布洛芬类退烧药或对乙酰氨基酚类退烧药。接种疫苗后发烧一般不超过72小时，超过72小时仍有发热，应及时带宝宝去医院就诊。
如果孩子发烧的体温是在38.5℃以下的中低度发热，可以给孩子进行物理降温，多喝温开水等方法处理，1到2天后即可好转，体温降至正常，如果孩子的体温升高到39℃以上或者反复、持续发热超过3天以上，要及时就医就诊。
打完手足口疫苗发烧，考虑到跟接种手足口疫苗有关。可以采取物理降温为主，用温水给宝宝擦颈动脉、腋下、大腿根、腘窝等处，有利于退烧。给宝宝物理降温时，注意保暖，以免受凉，诱发感冒的发生。
内服退热药物，可以用温水擦浴。如打手足口病疫苗发烧39度，这样的状况是十分常见的，因为手足口本身就是一种病毒，会引起发热的。可以适当的进行一定的抗病毒的处理。
一般来说，由于大部分疫苗都是使用了减毒活疫苗和异体蛋白，所以婴儿打完疫苗发烧了是很普遍的不良反应。发热不会发展成高热，体温在38.5℃以内，可以通过物理降温的方式进行退烧，可以用冰袋敷在宝宝的头部或者是用湿毛巾擦身体，同时要多给孩子饮水，促进身体的水分代谢。一般情况下两日后会自动消退，如果婴儿打完疫苗发烧了的情况一直持续，应该及时前往医院就诊。
