一般情况下，宝宝打手足口疫苗发烧，家长可以通过物理治疗、一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是手足口疫苗引起的发烧，家长首先要监测宝宝的体温，如果宝宝的体温不超过38.5℃，说明宝宝的身体状况良好，能够正常进食、喝水，没有明显的寒颤、嗜睡等症状。这时候主要是物理降温，可以给宝宝多喝温水、贴退热贴，退热贴重点放在额头或者颈部两侧。同时可以用温水擦拭宝宝的身体，重点是在额头、颈部两侧、腋下、大腿根、腘窝、肘窝等主要动脉的位置。擦拭的时候要注意不能用白酒或者酒精兑温水擦拭宝宝，以免酒精通过皮肤吸收。另外，疫苗接种后24小时可以用温水泡澡，洗澡时要避开针眼部位。如果宝宝的体温在物理降温后逐渐恢复正常，可以继续观察。如果物理降温不起作用，体温持续升高超过38.5℃，可以服用布洛芬类退烧药或对乙酰氨基酚类退烧药。接种疫苗后发烧一般不超过72小时，超过72小时仍有发热，应及时带宝宝去医院就诊。
如果孩子发烧的体温是在38.5℃以下的中低度发热，可以给孩子进行物理降温，多喝温开水等方法处理，1到2天后即可好转，体温降至正常，如果孩子的体温升高到39℃以上或者反复、持续发热超过3天以上，要及时就医就诊。
宝宝打疫苗后发烧需要及时观察，体温小幅度上升是正常的，如果持续上升，建议及时就医。
宝宝在注射过疫苗以后，可能会有一些不良反应，比如发烧、皮疹、或者是接触面上的肿胀。接种疫苗后，若有发热，应首先进行体温检测，通常情况下，由于接种后所产生的副反应，一般不会超过38℃，也不会持续很久。此时可以多给宝宝喝温水，解开衣服，注意孩子的身体状况，观察是否有其它的表现。如果宝宝发烧持续上升或者是情绪不稳定，最好及时就医。
小儿打疫苗发烧这是人体正常的免疫反应，体温会有增高。因为打疫苗引起的发烧，体温不超过38.5℃，持续的时间不超过24小时，很少有超过48小时。可以选择物理降温，让孩子适当喝点温开水，少穿衣服，少盖被子，或者温水擦浴、洗个温水澡，都是帮助孩子退烧的物理办法。
属于疫苗的不良反应，如果是单纯的发热，给孩子多喝点水休息，就能逐渐缓解的，如果发热温度比较高，可以使用退热药物治疗，严重的可以到医院进行就诊，看看有没有引起其他问题。
内服退热药物，可以用温水擦浴。如打手足口病疫苗发烧39度，这样的状况是十分常见的，因为手足口本身就是一种病毒，会引起发热的。可以适当的进行一定的抗病毒的处理。
