小儿脑炎主要由病毒感染引起。病毒感染的早期症状包括头痛、发热、人格变化和精神症状，如癫痫或发育迟滞、精神发育迟滞等，因此，不同类型的脑炎会留下不同类型的后遗症。黑斑蚊虫是日本脑炎的主要传播媒介。因此，彻底消灭蚊虫是预防脑炎最有效的方法。平时要饮食清淡，不要吃辛辣刺激性的食物。
宝宝脑炎康复后是需要进行复查才可以，只要是脑部没有软化灶，是不会有什么后遗症的，如果是出现了肢体的功能障碍，是需要及时的进行康复训练才可以。不放心可到医院就诊，在医生的指导下采取相应的措施。
一般情况下，婴儿病毒性脑炎是否有后遗症，需要根据婴儿的病毒性脑炎病情的轻重程度来判断。
如果婴儿是轻微的病毒性脑炎，及时给孩子进行抗病毒治疗，预防并发症的发生，多数情况下是能够痊愈的，一般情况下不会遗留后遗症。如果孩子病毒性脑炎的症状比较严重，伴有神经功能的损伤，可能会遗留肢体障碍、语言障碍或者是智力障碍等，需要尽早的给孩子进行康复性训练。
婴儿脑炎的后遗症一般都是会出现智力缺陷，大部分脑延及时治疗好后不会有后遗症的。目前对于脑炎的远期预后特点了解相对较少，神经及认知后遗症可能被低估了。通常说的小婴儿，就是新生儿脑炎，将来可能会出现脑积水性格改变等情况。
一般来说，脑炎的后遗症症状主要有：发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，甚至还会影响到大脑、丘脑下部等。
有些患者会出现兴奋多语、烦躁、哭笑无常、行为异常、失眠、记忆力减退、大小便失禁等症状。除此之外，智力下降，大脑迟钝，眼睛发麻，吞咽困难也会偶热如出现。严重的患者会出现癫痫性头痛、抽风、四肢抽搐等症状。
婴儿抽骨髓查脑炎有可能会造成局部出血，因为抽骨髓的时候有可能会骨髓针会碰到血管造成局部的小血管出血，可能会造成局部出血。还可能会导致感染，穿刺部位毕竟是一个小伤口，如果是穿刺完之后局部不注意清洁的话有可能会造成局部的感染、发炎、造成红肿等。