肛周脓肿主要的症状是疼痛，这种疼痛会非常剧烈，且逐渐加重，很多病人说会吃不下，睡不着。脓肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。部分病人还会出现大小便不畅、纳差、失眠。
婴儿肛周的脓肿早期会出现局部红肿、发热、便便干燥、尿黄等。在早期，它不会分解和化脓，也可伴有整个身躯症状：无食欲，常因疼痛和不适而哭泣，发热，便便干燥，尿黄等。在发病初期，娃娃的疼痛表现为肛门胀痛和化脓时的跳跃痛，特别是排便时，娃娃的疼痛会突出增加。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
肛周脓肿的表现症状会出现发热，红肿，浑身无力，食欲不振，瘙痒等症状，肛周脓肿可以配合医生口服一些药物来治疗，严重的情况下还需要通过手术的方法来治疗，肛周脓肿通常是便秘导致的一种疾病，新鲜的蔬菜和水果，多吃苹果。