巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
通常情况下，巧克力卵巢囊肿是子宫内膜异位症。
是指子宫内膜与卵巢发生异位所引起的一种囊肿。子宫腔内的内膜剥脱后呈暗红色，像是巧克力，这种情况出现在卵巢上，称为巧克力状卵巢囊肿。巧克力卵巢囊肿属于双侧，女性在月经期间会有左右下腹疼痛，这是痛经的症状。如果卵巢巧克力囊肿比较小，疼痛比较轻微，可以通过适当的镇痛来减轻；如果是巧克力性卵巢囊肿比较大，可能会出现蒂扭转，但术后很可能会出现复发。
巧克力囊肿会引起女性小腹疼痛，痛经，性生活疼痛，阴道内不规则出血，盆腔器官黏连。输卵管阻塞，影响受孕几率，如果长期没有得到有效治疗，会引起女性贫血。巧克力卵巢囊肿属于子宫内膜异位，而子宫内膜异位是导致不孕的重要原因之一。
卵巢囊肿手术分为开腹手术和腹腔镜下手术两种方式。开腹手术，充分做好术前准备后，在手术室内，由麻醉师进行麻醉，麻醉效果出现后行手术治疗。剖开卵巢皮质后，轻轻地拨除卵巢囊肿，用3-0的可吸收肠线逐层缝合、闭合瘤腔，术中未见明显出血后行卵巢皮质内翻缝合卵巢成形术，手术中尽量多保留卵巢的皮质。巧克力囊肿术中黏连致密，可以行卵巢楔形切除术后，再行卵巢成形术。腹腔镜下手术只是创伤微小。
是做穿刺，一般不是会很疼一点点疼，当然有条件，可以休息一周左右，卵巢囊肿一般不需要做穿刺，只要先观察吃点桂枝茯苓膏就可以。平时定期打B超复查，因为卵巢囊肿一般是良性的肿瘤，只要没有增大就没有关系，如果是在不断的增大，就可以通过手术处理。
附件区的囊肿多见长在卵巢上，可根据大小、症状决定治疗方法，有药物治疗、观察和手术切除，手术可分为微创和开腹。如果开腹手术时间和微创手术时间基本一样，术中如果顺利，一般一小时左右。需要在月经干净后一周之内做，这样会避免出血。
