巧克力囊肿是由于子宫内膜异位在卵巢，月经期异位子宫内膜发生脱落出血，在卵巢形成类似巧克力样的包块。发现恶性卵巢肿瘤者，应先予手术，术后予以中西药综合治疗。注意休息，良好的睡眠，避免过度劳累，清淡营养饮食，戒烟，戒酒。
巧克力囊肿不是炎症，卵巢巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种常见类型。因其周期性出血，陈旧血液聚集似巧克力样而得名。异位的内膜来源于子宫内膜组织，这些组织转移到宫腔以外的部位，种植和生长。
巧克力囊肿是一种代谢性质的疾病，主要是由于内分泌紊乱所致。巧克力囊肿的病因有很多，遗传因素、免疫因素、炎症性因素、出血性因素均有可能导致巧克力囊肿，当前对巧克力囊肿的病因的研究已较为深入，但还未完全掌握。
巧克力囊肿需要大约半个月的时间来恢复怀孕前的身体，并且疾病会在怀孕后恢复正常。手术后准备的妊娠越早，妊娠的可能性就越高。经过一段时间后，疾病复发了。此外，这种疾病的复发率很高。随着时间的推移，怀孕的能力会逐渐下降，手术后是最容易的时期。
巧克力囊肿妇科检查时常可触及一侧或两侧输卵管增粗或肿块。质实兼有囊性感，呈腊肠样或形状不规则，有轻触痛，活动常受限。排液后肿块缩小。液体积聚后又复增大。阴道排液为黄色水样液体，一般无臭味，量多少不一，常呈间歇性。这是本病最具特异性的症状。
