卵巢包块的性质很多，常见的有生理性包块，一般是囊性的，比如卵泡、排卵后形成的黄体、血体等，这些来一次月经后复查就消失了，是正常的生理性包块，不需要治疗。其他性质的包块常见的，比如畸胎瘤，是生殖细胞异常分化导致的，需要手术治疗。子宫内膜异位囊肿，也就是俗称的巧克力囊肿，是子宫内膜异位症导致的，可以用药物控制。
卵巢囊肿是一种良性妇科肿瘤，分为生理型和病理型。
囊肿的常见原因是内分泌失调或长期炎症刺激。如果是巧克力囊肿，可能是子宫内膜异位症或炎症刺激引起的。如果是恶性卵巢囊肿，可能是病毒感染引起的。
大多数生理性卵巢囊肿是由内分泌失调或卵泡未破裂引起的黄体囊肿等疾病引起的。病理性卵巢囊肿可分为普通卵巢囊肿和巧克力囊肿。
卵巢包块囊肿归属于“癓瘕”范畴，认为此病的发生多由七情损伤、房事过劳或经期、产后6淫外侵致使气机阻滞、脏腑失和、阴阳失衡而引起。因此，在治疗时，要针对其整体病因进行全面的、综合的分析，辩证施治，才能使疾病得以真正的解决。
附件包块，首先形成附件的几个组织，有输卵管，输卵管系膜，卵巢，这些组织任何一个部位发生了病变，都可以形成包块。比如最常听到的卵巢上的囊肿，比如因为附件区盆腔有炎症波及卵巢，形成卵巢的炎症，导致形成包块。
通常附件包块的类型不同，形成的原因也有一定的差异。如果是黄体囊肿造成的附件包块，通常是卵子排出以后，卵泡囊可能没有完全萎缩塌陷，LH激素刺激从而形成的囊肿。如果是普通囊肿造成的附件包块，考虑是体内高水平的雌、孕激素刺激形成。如果是卵巢巧克力囊肿造成的附件包块，那虑是子宫内膜组织异位到卵巢上，周期性的生长萎缩坏死而形成的。
有的是单纯的炎性囊肿引起，有的是卵巢的黄体囊肿形成的生理性囊肿包块。对于炎性引起的，进行消炎止痛治疗，而对于生理性的黄体囊肿，不需要进行特殊的处理治疗。卵巢炎症性包块，主要是发生于卵巢部位，以及卵巢周围组织的炎症，炎性渗出物聚集形成脓肿，或者炎性渗出物导致卵巢和周围组织发生粘连，形成炎症性包块。