染色体异常染色体异常是流产的主要原因。母体因素全身性疾病全身感染时高热可诱发子宫收缩引起流产；内分泌异常免疫功能异常。严重营养缺乏。不良习惯如吸烟、酗酒、过量饮用咖啡或使用海洛因等毒品。环境中的不良因素子宫缺陷如先天性子宫畸形、子宫黏膜下肌瘤、宫腔粘连等。创伤如挤压腹部或快速撞击，甚至手术、性交过度等。
引起先兆流产的原因是很多的，如胎儿自身的发育的情况、染色体的异常以及其他的环境等的因素等，如果B超检查胚胎发育良好有先兆流产的症状，应该绝对卧床休息两周，配合医生的药物治疗。
胚胎本身或遗传基因问题，精子和卵子成功结合成受精卵后着床发育，首要条件必须精子和卵子都是健康的，如果夫妻双方或一方有生殖系统的炎症，可能会导致精卵本身异常，这样的胚胎是不能继续成长的，这是自然界优胜劣汰的法则。还有，染色体非正常化等遗传问题，也会造成胚胎本身的变异，容易造成先兆流产。所以，夫妻双方的身体健康，良好的生活习惯以及孕前科学检查就显得尤为重要。
先兆流产原因男方可以查染色体、染色体断裂率、精子DNA完整率、精液分析、抗精子抗体、优生四项、支原体、衣原体、血型等。女方要查：染色体、染色体断裂率、优生四项、免疫、支原体、衣原体、内分泌六项、白带常规、封闭抗体、血型等。
先兆流产原因：孕妇方面：包括内分泌功能失调如黄体功能不健，甲状腺功能不足等，孕妇感染性疾病，毒性物质接触及生殖道畸形如双子宫，子宫肌瘤等均易导致先兆流产。胎儿方面的因素：则最突出的是受精卵的染色体异常，父体或母体生殖细胞不健全是主要原因，其他原因如脐带供氧不足，羊水疾病，胎盘病毒感染以及某些妇科炎症等，也会引起流产。外环境因素：不恰当的性生活尤其是在早孕早期易引起流产。
首先是胚胎因素染色体的异常，是早期流产的主要原因。其次是母体因素，母亲本身有一些基础性的疾病。最后黄体功能不足，因为孕酮低，导致先兆流产的发生。妊娠期间如有先兆流产征象，应及时就诊。
