由于精神紧张、药物及某些疾病影响到下丘脑、垂体、卵巢轴调节功能异常，导致卵巢间质、卵泡膜细胞产生过量雄激素，卵巢内高雄激素抑制卵泡成熟，从而出现一系列诸如闭经、多毛等多囊卵巢综合症的症状。
多囊卵巢的病因不是特别明确，主要属于多基因疾病，指多囊卵巢是先天的，从出生就决定，女孩是多囊卵巢高发人群，和后期的生活方式也有关系。比如长期进食高热量的饮食或者高脂饮食，不注意锻炼，导致肥胖，血脂血糖比较高的状态会诱发多囊的发生。以前只是一种基因携带，在外界环境影响下，有可能诱发，发生后有可能会恶性循环，造成多囊的症状加重。
多囊卵巢引起的原因迄今仍不一致，大概有：肾上腺功能初现时功能过盛，青春期肾上腺功能旺盛，分泌较多的雄激素。胰岛素抵抗和高胰岛素血症。遗传因素。多囊卵巢综合征治疗的目的主要是建立有排卵的正常月经周期，恢复生育能力，消除多毛。只要对症下药，都是可以治疗好的。
通常会引起月经不调的，通常女性会因为卵巢囊肿疾病出现月经稀少、月经闭经。还有功能性子宫出血等，会出现雄性激素过多，所以女性就会出现多毛的症状，有的是眉毛很粗很浓，上唇或者是外阴以及肛门的毛也会很多，有的女性还会有男性的一些常见现象。
若是出现肾上腺合成街体激素出现紊乱，会使得肾上腺皮质功能的过分亢进，从而造成过量的分泌雄激素，则会引起无排卵症状的出现，从而导致多囊卵巢的产生。胰岛素抵抗造成，肥胖为高胰岛素血症，大多是因为胰岛素抵抗而引起的。而引起女性出现胰岛素抵抗的原因也是众多的，多是胰岛素受体信息传导系统出现障碍而引起的。遗传因素也可见不少，且多囊卵巢呈现出家族高聚集性。多囊卵巢和基因异常有一定的关系，对于遗传性的多囊卵巢。
