一旦确诊为胎停育，如果没有发生自然流产，则需要及时手术清宫，来清除空腔内的胎儿和残留组织，以免发生感染，出血等更为严重。一般造成早期胎儿停育的原因，胚胎发育异常，染色体异常，还有体内的激素水平低。
胎停育后唯一办法为清除宫腔内残留胚胎的终止妊娠手术。胎停育后长期的滞留会造成稽留流产。如果二次胎停育，当须留下二次流产物且提取夫妻双方的染色体，进行遗传学的检测，寻找多次胎停育的原因。如果为女性免疫功能异常，则需在风湿免疫科专家的指导下进行治疗。
胎停育就要做全面检查，抗体检查放在最后，重点放在黄体功能、TORCH和肾脾功能，改变不良生活方式。要把检查的重心放在精子和卵子上面，通常空囊是由于精子质量不好，受精卵受到强辐射造成的。
胎停育的发生主要是由女方引起的，所以治疗的时候以女方为主，但是也不排除男性一方的原因，若女性检查正常，或有异常，同时男性检查有异常应同时调治，只要双方进行共同治疗。
胎停育后的女性在流产后要注意调理好自己的身体。此时女性的身体很虚弱，要注意增减营养，摄入足量的蛋白质，增强机体对疾病的抵抗力，促进子宫和卵巢的早日修复。这期间多吃些肉、鱼、鸡、蛋、乳类、大豆制品等蛋白质丰富的食品和富含维生素的新鲜蔬菜。
