药物治疗：对于诊断出卵巢内有混合性包块时，可据情况先保守治疗一到两个疗程，再次复查B超，如有缩小可不手术，若无改变或甚至有长大，就必须手术。日常饮食：应注意清淡饮食没，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型。平时多休息，避免劳累。注意囊肿破裂，避免剧烈运动。注意保暖，避免着凉，避免人工流产和刮宫及月经期同房。还是去做一下盆腔的彩超检查，根据检查结果选择手术治疗还是腔镜治疗还是药物治疗。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血，手术治疗是较好的治疗方式，对于巧克力囊肿，需要考虑手术，不是不想手术，就可以避免的，如何治疗要听医嘱，要据个人的身体状况。
目前卵巢巧克力囊肿比较大，需要做手术处理。术后是否会复发，因人而已，需要复查着看。放松心情，避免心理压力过大，注意休息，避免剧烈运动，不要吃辛辣刺激性食物，遵从医嘱，积极配合医生治疗。
治疗方法主要采用药物、手术治疗、激素疗法。中医可以通过中药调理，帮助卵巢恢复正常的排卵，达到正常的受孕。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法，治疗期间饮食要清淡，不要吃辛辣刺激食物。
以及治疗预后不一样，中医与西医见解不同，西医认为子宫内膜异位症属于雌激素依赖性疾病，治疗采取口服类雄性激素药，不同年龄不同生育要求治疗建议中医认为该病主要与痰瘀有关，痰浊阻遏经脉，影响冲任，致使经血不调，运行不畅，影响水液代谢，痰瘀是产生子宫内膜异位症症状和体征的关键。所以要慎重根据自身的状况来选择治疗。
