生殖道解剖结构异常，内分泌异常，生殖道感染，血栓性疾病因素，免疫因素，其他尚有男性因素，都是导致胎停出现的原因。现在需要检查明确导致胎停的原因，针对性调理确保下次安全孕育。
胚胎停育的原因包括：一、遗传因素。如果本身存在先天性遗传基因缺陷、染色体异常等问题时，就会增大发生胚胎停育的几率，常见的遗传基因缺陷主要是精子染色体异常或者卵子染色体异常。二、激素分泌不足。激素分泌不足也是一个导致胚胎停育的主要因素，激素分泌不足就会导致胚胎发育受到影响而造成停胎。三、子宫腔畸形。
生殖内分泌方面因为胚胎早期发育的时候需要三个重要的激素水平一个是雌激素一个是孕激素一个是绒毛膜促性腺激素如果母体自身的内源性激素不够就会造成胚胎的停育。
造成胚胎停育可能是精子和卵子不健康的原因，也可能是内分泌原因，如先天性黄体功能不良的病人在未受孕时，黄体周期短或分泌高峰不够，受孕以后尤其在早期，因为孕激素不够造成流产或胚胎停育。
造成胚胎停育的原因是很复杂的，大多数时候只是因为胚胎自身质量问题，是染色体突变的问题。发生几率本身在人群就占15%左右，所以一次的胚胎停育一般不找原因，下次怀孕之前可以先做孕前检查，比如甲状腺激素优生项目，血糖，血脂，血尿常规，支原体，衣原体等。
总是胚胎停育流产应该就是精子和卵子质量不好引起的。出现这种病况要及时到当地的正规医院做彩超监测卵泡，看看卵泡的发育是否正常，男性到医院化验精液常规，看看精子是否有畸形。再根据检查结果对症治疗。