输卵管堵塞的病因有很多种，如盆腔的炎症、妇科的炎症等，炎症会造成输卵管粘膜的损伤，从而形成疤痕，从而引起输卵管的狭窄，或者引起梗阻。此外，经期残留的一些物质，比如从子宫里脱落下来的内膜，就会流入输卵管，造成阻塞，甚至是剖宫产后，如果宫腔内的淤血不能及时排出，就会进入输卵管，造成输卵管阻塞。如果是先天性的输卵管狭窄，那么随着时间的推移，输卵管本身就会出现内膜脱落，从而造成输卵管的阻塞。
输卵管堵塞的病因有许多。除了先天性发育畸形导致不通外，还有妇科炎症盆腔渗出物长期刺激，相邻组织器官的病变等。妇科炎症感染，人工流产，长期阴道出血，不洁的性生活，如输卵管子宫内膜移位症、腹腔手术、阑尾炎手术、取放节育环、盆腔结核等，均可引起输卵管感染，而导致输卵管管壁充血、水肿、粘连而堵塞。
当发生输卵管炎时，输卵管的最狭窄部分及伞端很容易发生粘连而造成管腔狭窄或完全闭锁，这样，精子和卵子就不能在管腔内相遇，因而造成不孕。慢性盆腔炎多表现为双侧输卵管炎，久而久之使输卵管的开口，特别是接受卵子的那一端(称之为伞端)部分或全部闭锁，也可使输卵管内层粘膜因炎症粘连，使管腔变窄或闭锁，精卵的通行发生障碍，导致不孕。
输卵管堵塞的常见病因，除了先天性发育畸形导致不通外，还有妇科炎症盆腔渗出物长期刺激，妇科炎症感染，人工流产，长期阴道出血，不洁的性生活等都会造成输卵管堵塞的，所以要赶紧治疗。
双侧输卵管堵塞主要是由于不讲卫生、炎症、感染等有关的，输卵管堵塞是常见的不孕不育症，要及时治疗。所以在个人生活中要注意卫生，勤换洗内裤，不吃辛辣和刺激性大的食物，忌烟酒。
原因有炎症感染性因素、子宫内膜异位症、先天异常。炎症感染造成输卵管炎，特别慢性输卵管炎是造成输卵管堵塞与功能障碍的主要原因。感染常由性传播、流产、产伤等引起，可造成输卵管积脓、积水及盆腔粘连等。异位的子宫内膜病灶可引起输卵管结构破坏而造成输卵管堵塞。输卵管先天性发育异常，包括输卵管节段性或完全缺失；或有输卵管过于细长、过于蜷曲、输卵管无伞端等，影响精子、卵子或受精卵运送，发生不孕或宫外孕。