巧克力囊肿手术后需要恢复3个月-6个月，巧克力囊肿手术虽然不算大手术，但术后休息一周，是必须的，要恢复，可能需要一段时间。需要注意休息，注意切口卫生，不要熬夜。多吃新鲜的蔬菜和水果，少吃辛辣油腻刺激性的食物。如出现异常情况，及时去医院就医。
轻微巧克力囊肿吃药是治疗不了的。一般都会进行性增大。最终基本都需要手术，有生育要求的，必须尽早完成。手术后需要注意定期复查，巧克力囊肿有复发的可能。同时如果没有怀孕应该尽快怀孕的。
应该注意不能大量食用有活血补血作用的食物，也要避免吃过于生冷等多种具有刺激性的食物，要适量补充蛋白质等营养，有些病人可能会出现便秘等症状，所以就要少吃多渣类的食品，防止引发消化不良。保持良好心情，培养兴趣爱好，树立坚定的信心，消除焦虑情绪。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，即有生长能力的子宫内膜组织出现在子宫腔以外部位，就是子宫内膜出现在一个不该出现的部位。长在卵巢上的异位症经常形成囊肿，因囊肿内的出血日积月累，变得象巧克力浆一样，所以称“巧克力囊肿”。
巧克力囊肿术后饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用。
巧克力囊肿是卵巢子宫内膜异位症造成的，有活性的子宫内膜种植在卵巢上，随着月经周期的变化而变化，但是增殖脱落的子宫内膜和血排不出来，久而久之就形成脓肿。会出现不孕，痛经为主要症状。
