巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，应该来说去当地医院检查下，在医生的嘱托下，进行积极治疗，服药期间不吃辛辣刺激的食物，平时多喝水，温水清洗外阴，保持局部清洁，内裤开水消毒，不要有性生活。
有性交疼痛，白带增多、色黄或是有异味有的时候也可出现白带夹有血丝的情况，早期症状是痛经，且呈进行性加重，有的也可没有症状，是由于不孕症，去医院检查时才发现的。囊肿到不是很大，是否需要手术治疗，看自己的自身条件。
巧克力囊肿会出现性交痛，这是最明显的症状，而且常于月经前较为明显，也有少数女性会因巧克力囊肿而引发白带增多、色黄或是有异味，也可能回出现白带夹有血丝等症状，可能去正规的医院检查一下。
应根据年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求等加以选择，强调个体化治疗。症状轻或无症状的轻微病变选用期待治疗；症状及病变均严重的无生育要求可行性手术。手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症引起的。子宫内膜异位症是指子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位。其发病原因可能是经血逆流。有的子宫内膜异位症，没有任何症状，但大多都会表现为下腹痛和痛经，不孕，性生活不适，月经异常和子宫内膜异位囊肿，子宫内膜异位囊肿就是卵巢巧克力囊肿。
卵巢巧克力囊肿的常见症状，性生活痛、这是卵巢巧克力囊肿最明显的症状，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症等均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；白带异常；痛经；即使没有避孕也不会出现怀孕的情况。