月经时头痛，是内分泌、激素波动造成的现象，主要与血中雌二醇浓度变化有关。在经前后血清中雌二醇浓度降低，血管张力会发生变化，部分对此敏感的人会发生头痛现象。月经后浓度恢复正常，症状会有所缓解或者消失。还有可能是精神压力，导致大脑处于紧张状态。由于特殊时期抵抗力较弱，容易发生偏头痛。
偏头痛的发作常有诱因，的诱因也有很多，比如睡眠障碍、过度劳累、饮食，对于女性较为多见偏头痛的发病机制目前尚不清楚，所以月经期及月经来潮期，偏头痛也属于比较常见的现象。如果头痛剧烈，可以对症吃些止痛药物。
月经期头痛头晕，考虑跟月经量大有关系，再就是经期紧张综合症。建议注意休息，保证充足的睡眠，多吃蔬菜水果，少吃生冷辛辣刺激性的食物，如果疼痛的厉害，可以对症治疗，吃消炎痛，查性激素了解是否内分泌失调导致经量多，注意复查生殖疱疹病毒。
来大姨妈头痛可以通过以下方法进行治疗，具体如下：
在经期有头痛症状时，要注意清淡饮食，避免喝含酒精、咖啡因的饮料，防止头痛加重。可适量吃纯牛奶、水果、蔬菜、燕麦、牡蛎等能缓解激素作用的食物，还可适量吃含糖高的食物，使血糖容量升高后，缓解心脑血管紧张状态，从而缓解头痛感。此外，还可以适当的按摩太阳穴，有一定的效果。
大姨妈头疼中医称为经行头痛，主要是因肝气郁结、瘀血内阻、气血不足导致的。
肝气郁结导致的头痛主要表现为头晕目眩、暴躁易怒，可以用羚羊钩藤汤、平肝熄风止痛；瘀血内阻的头痛主要表现是头痛剧烈、痛如锥刺、经色紫黯有块，可以用通窍活血汤化瘀通络止痛；气血不足导致的头痛，主要表现有头痛较轻、月经量少等，可以用八珍汤养血益气止痛。
可能是因为来大姨妈的时候出现短暂性的脑缺血，缺氧引起大脑动脉痉挛，引起头痛是正常的，如果出现头痛，可以通过口服药物进行治疗，期间应该多注意休息，不要过度疲劳及剧烈运动。