月经不调，月经过多，月经血量多，是卵巢巧克力囊肿临床常见症状，痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。性生活疼痛也是一个明显的信号，严重了可能还伴有点状出血。
轻度巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。常见的有痛经、下腹痛、经期发热，痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重，性交疼痛也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显，还会出现不孕及月经失调等症状。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血，手术治疗是较好的治疗方式，药物只是可以抑制，并不能彻底的解决问题，对于巧克力囊肿，是需要考虑手术，不是不想手术，就可以避免的，如何治疗要听医嘱，要根据个人的身体状况。
卵巢巧克力囊肿，是子宫内膜异位症的一种，症状表现为，痛经、性生活时疼痛、突发性的剧烈腹痛，并往往伴有肌紧张、反跳痛等腹膜刺激症状。还有不怀孕及月经失调等症状。盆壁相粘连的囊性肿块，活动度差，往往有轻度触痛。
巧克力囊肿每次月经期时，异位的子宫内膜细胞也少量出血，出的血又不象子宫内的月经血有通道排除体外，而是由腹膜包裹，再出血再包裹，月复一月地积聚，其间也由腹膜吸收一部分，剩下的变成一种陈旧性积血，颜色如同巧克力样地咖啡色。
