中医治子宫内膜异位症采用中医理气活血，通淤散结之法为主。治疗原则是温经散寒、活血化瘀、软坚散结、消肿止痛，通过用中药，使异位的包块要逐渐的液化。缩小、吸收，临床症状会随着异位包块的缩小而减轻，或者全部消失。
子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
活血通腑法具有改变血液流变学。改善全身和局部血液循环、降低血浆前列腺素含量和抑制异位内膜生长等作用。故运用此法治疗子宫内膜异位症确具良好效果。平时需要注意休息，避免劳累熬夜，适量锻炼，加强营养，增强体质。
如果子宫内膜异位不严重，现在可以使用活血化瘀的药物保守治疗，可以缓解大姨妈引起的疼痛。如果子宫内膜异位症严重，有明显的肿块，可以考虑手术治疗。子宫内膜异位是具有活性的子宫内膜生长在子宫以外的地方，异位的子宫内膜组织随着大姨妈周期发生变化。
子宫内膜异位的中医辨证治疗多以活血化瘀或补养气血的原则，中医认为肝藏血，肾藏精，所以在用药上多选择补益肝肾，滋养气血，加上活血化瘀的药材。还可以选择口服药物，加上中药、针灸。