霉菌性阴道炎在最顽固的一种阴道炎，单纯的药物治疗效果不是很理想，而且会反复发作的，较好的治疗方式是药物结合物理治疗，比如，射频，短波，红光等，是可以在短时间内促使炎症快速吸收，简短治疗时间。
用碱性溶液如2~4%碳酸氢钠或肥皂水冲洗外阴及阴道，改变阴道酸碱度，使不利于霉菌生长，冲洗后，再用制霉菌素片剂或栓剂塞入阴道内，每次10万~20万单位，每晚一次，10~14天为一疗程，外阴再涂以3%的消炎药，效果可更好。
如果患有念珠菌性阴道炎应该使用药物治疗。
建议患者首先在阴道内放置制霉菌素阴道片，这种药物有很好的抑制念珠菌感染的效果，也可以选择保妇康栓，这种药物属于中成药制剂，能够抑制真菌感染。在治疗期间要让患者保持阴部清洁，避免发生性生活，避免吃辛辣刺激性的食物，否则很可能会诱发反复感染的，也可以口服一些抗真菌的药物，例如口服酮康唑等等。
如果检查白带常规明确是念珠菌性阴道炎，即真菌性阴道炎。主要表现为白带增多，瘙痒，异味等，通过不洁卫生，尤其是经期及性交卫生，再者经常吃辛辣刺激油炸食物有关系的。
念珠菌性阴道炎的治疗方法是改变阴道酸碱度，因此采用碱性溶液冲洗外阴，阴道，改变阴道的酸碱度，对霉菌的生长繁殖会有抑制作用。外用药膏治疗，因霉菌感染引起的外阴炎，减轻外阴痒痛的症状，还要保持外阴清洁干燥，避免搔抓，治疗期间禁止性生活，不宜食用辛辣刺激性食品。
念珠菌性阴道炎属于白色念珠菌感染引起的一种比较顽固，容易反复的阴道炎，日常要特别注意会阴部的卫生。在治疗期间是也是要禁止性生活的。一般都是要治疗2周复查，如果白带正常了，才可以停药性生活的。