巧克力囊肿治疗时间是不确定的，要看病人的病因以及地方，不同地方治疗费不一样的，巧克力卵巢囊肿治疗方法主要采用药物和手术治疗。药物治疗包括：假孕疗法，假绝经疗法等，但只能缓解症状控制发展，停药后，即复发，故对卵巢巧克力囊肿多主张手术治疗。
巧克力囊肿手术虽然不算大手术，但术后休息一周，是必须的，要完全恢复，可能需要一个多月的时间。注意休息，注意切口卫生，不要熬夜。多吃新鲜的蔬菜和水果，少吃辛辣油腻刺激性的食物。如出现异常情况，及时去医院治疗。
巧克力囊肿术后半个月能冲凉碰水，术后需要保持伤口清洁，干燥等伤口完全愈合后，方可淋浴，每天一定要注意伤口有无红，肿，热，痛的现象，以防感染发炎的发生，要及时注意并且发现。
巧克力囊肿又叫“卵巢子宫内膜异位症”，这是子宫内膜“跑”到了卵巢组织内部，并和子宫同步出现周期性出血，这些陈旧血液，日积月累变成了巧克力样的颜色，故叫巧克力囊肿。形成巧克力囊肿时间是比较久的。调整好自己的心态。有些时候，心理上的压力会导致月经异常。精神上受挫折、压力大等负面情绪，均会造成月经异常，所以女性朋友必需调整好自己的心态，保持良好的心态非常必要。
三个月，巧克力卵巢囊肿治疗方法主要采用药物和手术治疗。药物治疗包括：假孕疗法，假绝经疗法等，但只能缓解症状控制发展，停药后，即复发，故对卵巢巧克力囊肿多主张手术治疗，手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术，有生育要求的年轻人，可行囊肿剥离术加卵巢成形术，不需要生育的，行半保守手术，即全子宫切除加患侧附件切除术。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成，通常会引起进行性的痛经，甚至是导致不孕，当卵巢巧克力囊肿大于五公分以上，而且引起痛经严重，考虑行腹腔镜手术来将卵巢巧克力囊肿切除，一般在切除手术以后，禁止同房和盆浴一个月。
