避免人工流产，经期避免剧烈的活动，口服避孕药。注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，要注意自身保暖，避免感寒着凉，月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。
巧克力囊肿病到目前为止，除去手术切除巧克力囊肿没有更好的方法，能去医治。手术以后应该调整个人的情绪。饮食上宜清淡，饮含营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性食物、海产品等。
行经前后，尤须注意进食过热的汤、菜，生冷食物均属禁忌。谷类、薯类作为主食，均可食用，无需避免。肥厚油腻，易于滞瘀，少食为好。子宫内膜异位症病人清淡疏利之品较为适宜。干果不忌，可随时食用。养生行血，核桃温阳，大枣、桂圆益气养血，更为适用。
巧克力囊肿破裂后应立即就医，通过手术进行治疗。
巧克力囊肿破裂是子宫内膜异位症的一种病变。正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔内，受体内女性激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿，即巧克力囊肿。通常巧克力囊肿破裂后，应立即就医，通过根治性手术进行治疗，并辅以药物治疗。
巧克力囊肿子宫内膜异位症的一种，是外源性子宫内膜异位症的一种，这种病在西医上北称为：“不死的癌症”是一种经久反复的疾病。这种病中医保守治疗。中医保守治疗只要对症就能见效，中医保守治疗后复发率低。对于有生育要求的，建议中医保守治疗。
B超发现卵巢囊肿，一定要医生当时明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的，b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。因为子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。