做巧克力囊肿手术和输卵管手术是不会感觉到疼痛的，因为都会做全身麻醉，但是随着手术后随着麻醉药效消失之后，肯定是会导致病人出现疼痛表现，只是疼痛程度并不严重且大约持续2到3天不等。
巧克力囊肿打针有一定的疼痛，要治疗卵巢囊肿还得从改善自身的体质开始。多吃碱性食品，同时补充人体必须的有机营养物质，恢复自身的免疫力。宜多吃具有抗肿瘤作用的食物鳖、龙珠茶、山楂、芝麻。忌烟酒、葱蒜椒等刺激性食物。忌肥腻、油煎、腌制食物。忌羊肉、胡椒等温热动血食物。
及时去正规的医院做进一步的检查，然后根据检查结果，尽快选择合理的方法手术治疗。如果病情发现的比较早，治疗的比较及时，相信病情也是可以缓解的，在治疗过程当中，病人一定要把心情放松，思想上不要有什么压力。
巧克力囊肿手术后还会痛经，在手术之后还会有痛经的症状，这主要是因为本身的痛经并不是因为卵巢肿大所导致的，或者说痛经除了巧克力囊肿之外还有别的诱发因素，所以会导致做完了巧克力囊肿手术之后依然会痛经。
巧克力囊肿手术十天后，腹部仍然疼痛考虑是因为手术不适应引起的现象的情况腹部疼痛，术后一个月内，不宜干体力活，以免造成子宫下垂，多吃些富有营养的食物，使身体尽快恢复正常。
巧克力囊肿手术后乳房痛可能是因为乳房因气滞血瘀导致的胀痛。饮食上需要注意多吃富含蛋白质、维生素的食物以外，还有其他的注意事项。月经期间的女性一定要杜绝性生活，要注意自身的保暖，避免感冒、受凉。