卵巢囊肿恶变的时间，因人而异，要考虑卵巢囊肿的情况。囊肿超过5公分，就应该考虑行腹腔镜手术将囊肿切除。首先就应该进行全身麻醉，腹部全面消毒，在腹部取2~3个小孔，将腹腔镜和超声电凝刀伸入到腹腔内，同时还要在腹腔内注入二氧化碳，然后在腹腔镜的引导下将卵巢囊肿切除。
卵巢囊肿来自癌症，会显示肿瘤标志物不正常，也可以通过观察卵巢囊肿的生长速度，判断是否产生癌变，如卵巢囊肿直径在一到两个月内一到两次，生长得更快并且会出现双侧卵巢囊肿，应谨慎排除癌变的可能性，这应该做相关检查，检查是否有可能恶变，肿瘤标志物发现或不能排除恶变应采取手术治疗。
卵巢囊肿不一般不会癌变，卵巢囊肿，一般多为良性肿物。卵巢囊肿一般不会癌变。但一旦发现卵巢囊肿，卵巢囊肿如果有增大趋势，还是建议要手术切除的。主要还是平时注意休息，避免熬夜，不要吃辛辣刺激性的食物，适当的增加锻炼增加抵抗力，可以服用针对性的药物进行治疗，不过还是需要定期随访的，如果有增大需要手术的。
女性在患上巧克力囊肿后一般会伴有呕吐、低烧、小腹疼痛、腰椎酸痛的症状表现，卵巢巧克力样囊肿属于子宫内膜异位症，基本不会恶变，但是会伴随逐渐加重的经期腹痛。而且囊肿会逐渐增多，随时有破裂或者卵巢囊肿蒂扭转的危险，所以即使不会恶变也应该考虑手术切除。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
