对于巧克力囊肿这种妇科疾病，最合适的方法是使用腹腔镜手术，这种方法不用进行开腹，伤口小，流血少，恢复更加的快，整个过程也只有一个小时左右。但是对于宫腔有炎症粘连的，还是采取开腹手术的方法，这样能够得到更好的治疗效果。
巧克力囊肿做的开腹手术，是需要恢复一年才能怀孕的，新鲜的瘢痕在妊娠末期或分娩过程中很容易胀破，而造成腹腔大出血甚至威胁生命。因此，怀孕要在手术一年以后较为安全。期间需要注意饮食的合理性，注意休息好、保持一个良好的心情很重要，确定完全恢复后再怀孕。
需要三个月左右才能治好。巧克力囊肿是子宫囊肿的一种，属于良性病变，会伴随有增生、转移、复发等情况的出现，而且会造成痛经、月经失调等，因此建议还是及早治疗比较好，需要服药三个月左右进行巩固治疗，另外需要随时复查。
对于巧克力囊肿能需要治疗多久是要看个人的情况的，每个人的体质不同，时间也就不同。平时要注意自身保暖，经期，禁止激烈体育运动及重体力劳动，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累。情况严重时要手术进行治疗。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症，内膜异位到了卵巢，每个月卵巢异位灶反复出血引起囊肿，并且引起盆腔粘连。容易导致输卵管粘连，引起不孕症。手术后一般要休息一个月，在术后一个月内要注意休息，禁止性生活，所以一个月以后可以同房。
巧克力囊肿手术一般为微创手术，通常一周左右可以恢复正常饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用，因为此类食物中含有雌激素，会对子宫内膜异位的囊肿有一定的影响。
