如果药物流产不干净，做清宫，不会对身体有影响。清宫之后大约需要两周的时间，在此期间不能接触冷水或感冒。那么就需要注意饮食，不要吃太冷，也不要吃太辣的食物，不容易消化的饮食也不要吃。注意个人卫生，避免感染，以免将来影响身体健康。
宫内有残留不做清宫排不出来有可能会引起宫腔感染，还有可能会引起炎症大出血等现象。应该在做彩超复查一下，如果有残留就应该及时做清宫，清宫后应用消炎药，避免引起宫腔感染。
清宫不干净，会给子宫留下严重的后遗症，在日后需要进行很好的治疗。在日常生活中应当有合理的性行为，在性行为之前要使用避孕措施，对于宫腔残余量比较少的情况下，可以不刮宫。等下次月经来潮时会随着经血排出.一旦发生了意外怀孕，会对女性身体产生不利的影响，要及时进行引产手术。
一般情况下，药流不干净指药物流产后子宫内有残留妊娠组织，此时如果不及时行清宫手术，则可能出现感染、贫血等后遗症。药物流产是通过药物干预来自行将妊娠组织排出体外，可能会导致子宫内有残留妊娠组织，如未及时行清宫手术，可能会导致残留妊娠组织在子宫腔内出现机化，可能会导致子宫、阴道出血不止，易引发感染、贫血等后遗症。因此，如药物流产后，患者子宫内有残留妊娠组织，患者应及时行清宫手术进行治疗，以促进患者身体恢复健康，避免炎症感染。
如果药流不全可能出现阴道流血时间长，反复出血或者大出血的现象，需要做清宫治疗。药流后注意休息，观察阴道流血情况，如果超过十天没有干净需及时到医院复查，确定存在残留，需考虑做清宫治疗，以后注意采取有效避孕措施，避免再次意外怀孕。
药流不干净不清宫有可能会引起炎症的感染，发生子宫内膜炎，严重的累及其他器官还可能出现输卵管炎、盆腔炎等，甚至影响以后的生育。药流后应该b超检查一下宫腔内容物是否已经排出。