卵巢囊肿如果比较小，不影响生育；如果比较大，影响生育。
卵巢囊肿如果比较小，而且是生理性的，一般不会影响生育，不需要太担心。如果是病理性卵巢囊肿，并且卵巢囊肿比较大，可能会导致怀孕的几率下降，但是一般不会导致不孕。如果双侧都有很大的囊肿，就会导致卵巢无法排卵，从而导致不孕。
建议有卵巢囊肿的女性，无论是否影响生育，建议及时去医院妇产科就诊，必要时进行手术治疗。
左侧卵巢囊肿是否会影响生育，需要根据囊肿是否会影响卵巢排卵决定。
如果是单纯性卵巢囊肿不超过5cm，那么在来例假后就会自行消退，不会对排卵造成任何的影响。卵巢巧克力囊肿、囊肿比较大，没有正常的卵巢组织，会影响到卵巢的排卵，从而影响到生育。另外，卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，会引起输卵管粘连、盆腔粘连，从而影响输卵管输送精子和卵子，从而引起不孕或宫外孕。
左侧卵巢囊肿可能影响生育，但是不大。
人体的卵巢位于身体的两侧，即便是左侧卵巢囊肿持续增大，可导致分泌卵细胞出现异常，还会由右侧的卵巢囊肿来分泌卵细胞的。但是也要注意观察身体的激素水平是否异常，如果有卵巢囊肿的同时伴有激素水平失调，就可能会影响到双侧卵巢排卵，患者就要及时进行调理了，否则很可能会导致出现不孕不育等情况。
卵巢囊肿对生育的影响取决于囊肿的具体情况，体积比较小，囊肿很小，对排卵功能就没什么太大的影响，还要进一步看检查是巧囊还是单纯性的囊肿。如果囊肿没有达到手术的标准，而且还有生育的需要，那么则建议以缓和的方式来解决，可以中医来治疗。
卵巢囊肿是最为常见的卵巢疾病之一，常见的导致囊肿的因素有许多，根本原因，有遗传因素，20%左右的卵巢囊肿是有家族史的。还有内分泌因素，由于内分泌失衡，通常在育龄的时候，发生卵巢囊肿的问题。