保留生育功能手术：切净或破坏所有可见的异位内膜病灶、分离粘连、恢复正常的解剖结构，但保留子宫、一侧或双侧卵巢，至少保留部分卵巢组织。适用于药物治疗无效、年轻和有生育要求的患者。药物治疗：也就是激素疗法，通过药理刺激体内激素分泌，因为异位内膜对卵巢内分泌有反应，所以采用性激素治疗，主要是抑制排卵或引起闭经，使异位内膜发生退行性变，继而坏死、吸收。
子宫内膜异位症要抓住早期治疗，控制子宫内膜异位症发展，防治疗后复发。子宫内膜异位症的治疗方法很多，有手术治疗，西药及中药治疗。西药治疗子宫内膜异位症：多为以假孕疗法为基础。中医中药治疗子宫内膜异位症：具有缓解疼痛、调经助孕、改善症状等显着疗效，同时通过对内分泌、血液流变学、生殖、前列腺素合成于代谢及免疫等方面进行调节，改善生殖系统的功能，以达到提高受孕率的目的。
子宫内膜异位症术后备孕可以试孕或者是去生殖中心接受辅助生殖技术的助孕。保守性手术的复发率可以高达50%，甚至更多，复发后体内又会出现原有的紊乱。凡有生育要求的患者，要尽量争取在停药半年内怀孕，因为停药后随着月经的复潮，疾病往往还是会复发。所以子宫内膜异位症患者如何备孕需要由专业的医生根据病情、术中所见、生育指数评分给出个体化的建议。
子宫内膜移位症可以预防，注意保持心情舒畅，情绪稳定，做到劳逸结合。饮食调护：经期前后忌食生冷寒凉之物，以免寒凝而使血瘀加重，经血量多或有内热者，应忌食辛辣香燥之品及发物。
子宫内膜异位症的分期总共分为四期，时期里面有很多评分，当达到一个分值以后，就归为哪一期，这是做完手术以后，根据术中的情况来分期的，不是单纯的把这病人看一下、摸一下就能分期，分期是比较复杂，也是比较专业性的一个标准。主要是分为四期，区别越重预后越不好治疗，无论手术还是后期的治疗都是比较麻烦的，病人复发的几率也就越高。
子宫内膜异位症合并重度痛经者，可口服药物缓解痛经。如果月经量多并且伴有性生活的，平时在月经期间一定要注意保暖，不要着凉，不要吃生冷辛辣刺激性食物，以免加重子宫内膜异位症引起的痛经的情况。
