孕酮低是会影响月经的。可以去医院做一下孕酮检测，查明原因后在医生的指导下适当的补充孕酮。平时要注意休息，不要劳累，生活规律，保证睡眠充足，多吃富含维生素的新鲜蔬菜和水果，不要吃生冷辛辣刺激性的食物。
孕酮低会造成月经不调，孕酮也是一种性激素，如果分泌减少就会影响月经，可以用人工周期治疗，服用几个月经周期。平时保证充足的睡眠，不要熬夜，充足的睡眠有利于体内激素的正常分泌，体育锻炼。
月经不调也称月经失调，是一种常见的妇科常见病，表现为月经周期或出血量的异常，或是月经前、经期时的腹痛及全身症状，孕酮低与没有正常排卵还是有关系的。建议月经来潮第三天抽血化验一下性激素六项，根据检查结果。按疗程规律用药调理就可以了。
怀孕和好多因素有关系不一定只是月经不调的原因，还是详细检查一下，最直接的关系就是孕妇是否排卵，排卵和好多因素也有关系，环境因素，药物因素，身体其他疾病的影响，你应该测一下基础体温，连续三个月，确实不排卵可以用促排卵的药物治疗。也应该寻找不排卵的原因。
孕酮跟月经也有着一定的关系，但是月经不调不完全是因为孕酮引起的，主要还是因为内分泌紊乱出现的情况，所以可以去医院做一个详细的检查，看看到底是哪一方面引起的，然后再吃中药慢慢的调理，使自己的身体能够得到一个很好的恢复，这样才可以更好的备孕。
孕酮低月经不调是因为内分泌失调导致的。尤其是垂体-性腺轴异常的可能性比较大，同时可能与卵巢功能异常有关。可以使用中医针灸、穴位埋线结合中药综合调理，效果比照单一使用药物，尤其是单一使用激素要好得多。