卵巢囊肿和卵泡组织结构和形态是完全不一样的卵泡属于生理排卵，囊肿属于病理性，女性因为工作不能有良好的饮食习惯，或生活习惯不好都是能导致体质过度酸化，人体的身体功会整体的下降，引起肾虚，最后导致卵巢疾病和内分泌失调，使之发展成为卵巢组织增生，导致囊肿的出现，这时就会对排卵造成很大影响。
卵巢囊肿是属于病理性的，卵巢的囊性增生病变，而卵泡是属于生理性的排卵现象，一般需要做几次B超才能够确定，如果是卵泡，在排卵结束之后，卵泡就会没有了，B超看不到了。如果是卵巢囊肿，那么跟生理周期没有太大关系，排卵结束还会有。
一般情况下，卵泡不是卵巢囊肿，具体分析如下：
卵泡不属于卵巢囊肿，卵巢上没有卵母细胞或黄体，也没有形成成熟卵子的细胞，所以不能成为囊肿。卵泡与卵巢囊肿之间仍存在差异。卵泡通常较小，多数卵泡<25mm，但卵巢囊肿通常较大，通常>20mm，有些囊肿可>50mm；卵泡通常为较规则圆形或椭圆形囊性结构但囊肿多为圆形或其它较规则形状；超声观察时卵泡液回声为均一液性暗区但囊肿可呈弱回声，弱回声或强回声且回声可不均匀。
卵巢癌属于卵巢恶性肿瘤，在早期常无症状。而卵巢癌一旦有不适症状，往往就属于晚期，比如会出现便秘，腹胀，或者自己摸到腹部包块。卵巢囊肿包括卵巢生理性囊肿，卵巢良性病理性囊肿以及卵巢恶性肿瘤。
良性卵巢囊肿病程长，囊肿逐渐长大，多无不适症状；而恶性者病程短，囊肿迅速长大，且有时可伴有发热。良性者多为生育期妇女，情况良好；而恶性者发病多见于青春期前少女、青少年或绝经后妇女，病情发展快。
卵巢囊肿是由卵巢局部的病理改变引起的，目前尚不明确。宫外孕指的是怀孕导致的一种异常现象，即是指妊娠囊在宫腔之外的地方生长、发育。这是两种疾病的根本不同，可以通过血液检测HCG来进行鉴别。宫外孕可以发生在卵巢、输卵管、宫颈部位、腹腔、盆腔内妊娠。一经发现应立即进行处置，否则将产生严重后果。如果是输卵管囊肿破裂或蒂扭转，则要择期手术。